MADRID, España.- Joaquín E. Weiss en la obra La arquitectura colonial cubana. Siglos XVI al XVIII remonta la edificación de la Iglesia de San Francisco de Asís y la del convento adjunto, a las últimas décadas del siglo XVI. Añade que son pocas las noticias acerca de su arquitectura, pero debió ser sólida, pues perduró hasta finales del XVII en que la abatieron varias tormentas, por lo que se reconstruyó entre 1719 y 1738.
El obispo Pedro Agustín Morell de Santa Cruz, en La visita eclesiástica ─recorrido por el país de 1754 a 1757, apunta que no tenía que envidiar a otra iglesia y que en ella echó el resto de su magnificencia su antecesor el obispo Juan Lazo de la Vega; dato que reitera Weiss, quien agrega que el templo de San Francisco fue por muchos años el más elegante de La Habana y que de la capilla de la Tercera Orden partía el Vía Crucis que terminaba en la iglesia del Santo Cristo del Buen Viaje.
A inicios de la década de los años cuarenta del siglo XIX se dispuso su cierre y luego el gobierno la destinó a depósito de mercancías y los claustros a habitaciones para funcionarios subalternos. Parte de sus religiosos se trasladaron a Guanabacoa. Sin embargo, en el segundo decenio del XX reconstruyeron la iglesia y el convento.
En abril de 1966 el templo de San Francisco de Asís quedó cerrado al culto y reabrió en 1987. En la misa de reapertura, el 23 de diciembre, Monseñor Giulio Einaudi (1928 –2017), nuncio apostólico en Cuba de 1980 a 1988, relató ─y reprodujo Palabra nueva (Homilia-05.PDF)─ que la Tercera Orden Franciscana se había unido a la Cofradía de la Santísima Veracruz en sus cultos y fabricado una Capilla entre 1608 y 1618. Mas en 1841, al ocupar el Gobierno colonial el Convento de San Francisco por la ley de la exclaustración, es despojada de su Capilla y el Capitán General propone trasladarla a la iglesia de San Agustín, en el ángulo de la calle Cuba con la de Amargura, de donde habían tenido que salir los agustinos, afectados por la misma ley. Y detalla:
“En sesión del 9 de enero de 1843 de la Tercera Orden Franciscana se da cuenta de haberse recibido la Real Orden del 2 de noviembre de 1843 permutando la Capilla de la Veracruz por la iglesia de San Agustín. (…) Tomaron posesión definitivamente el 19 de septiembre de 1896. Tanto en la iglesia como en el Convento se hicieron grandes reformas. En el año 1925 se inauguró la iglesia reconstruida gracias a los esfuerzos gigantes del P. Juan Pujana. De lo anterior solo se respetaron las paredes exteriores, pero aun estas hubo que levantarlas a mayor altura, después de reforzarlas y revestirlas, de acuerdo con el estilo general del renacimiento español”.
En 2003 la iglesia sería nuevamente restaurada por especialistas de la Oficina del Historiador de la Ciudad y reabriría una vez más en octubre de 2008, el Día de San Francisco de Asís.